Буду знать.
После перезагрузки оказалось, что воспроизвелась ситуация годичной давности - один файлик с расширением .CLO оказался переименован в расширение .clo, а одной софтине (не буду показывать пальцем, хотя это был binkd, also inb4 "коммент про некрофилию") оказалось не пофиг на регистр буковок в расширении, и файлик она видела, но не обрабатывала. Тогда, год назад, поймать переименовывателя за руку не удалось (этот комплект софта без существенных изменений работает уже не первый десяток лет(!), а такой случай был впервые), а вот сейчас, похоже, удалось.
В логах chkdsk (он их кладёт в eventlog, видимо потому, что на диск писать не может - он же его как раз проверяет. Правда, eventlog физически хранится на том же самом диске, но это его уже не волнует) нашлось вот такое вот прекрасное:
The upcase file content is incorrect.
Correcting errors in the uppercase file.
...я ведь правильно понимаю - это оно самое и есть, был файл в uppercase, а потом его исправили? Забавная система - виндоуз. Впрочем, binkd в этом случае оказался ничуть не менее забавен :-)