В самом деле. Пусть у каких-то достаточно высокоорганизованных существ (с половым размножением, хромосомами, вот этим всем) в результате эволюции образовалось что-то новое, и на тот момент полезное - ну, тот же хвост. За миллионы лет эволюции "хвост" в генотипе популяции оптимизируется, к "генам хвоста" начинают прилипать побочные функции (скажем, выясняется что вот этот завиток хромосомы отвечает не только за пушистость шерсти на хвосте, но и способствует значительно более полному хренальбуксицидилированию бубльгумдигексанитроаминобульбазы в метаболическом цикле бубльгумирования бульбы, чем применявшиеся ранее методы), "ген хвоста" врастает в генофонд, обрастает связями, и гармонично вписывается в жизненный цикл в целом.
Всё! С этого момента вычистить "ген хвоста" из генофонда - задача сложная, и в дикой природе практически нереализуемая, даже если хвост больше не нужен и вообще мешает. Ведь чтобы это произошло, нужна такая мутация, которая не просто уберёт у особи "ген хвоста", но и не поломает при этом те связи и функции, которыми этот хвост успел обрасти, да ещё и обеспечит потомству в целом лучшую по сравнению с соплеменниками выживаемость - иначе "бесхвостый" генотип просто растворится в море "хвостатых". А у этих высокоорганизованных ведь ещё и контрольные суммы при копировании ДНК сверяются, резко уменьшая вероятность мутаций, это бактерии мутируют непрерывно, с их плодовитостью это идеальная стратегия...
А вот постепенно сокращать выраженность какого-то признака - перемещая ген по хромосоме, или обнося его "управляющими последовательностями" - эволюция умеет великолепно, чему примером является всё или почти всё современное сельское хозяйство и животноводство (кроме ГМО). Соответственно, если хвост стал не нужен - эволюция быстренько сократит его до нуля (ну, почти до нуля), но выкидывать не будет.
Ибо - вдруг пригодится! Ведь удлиннять уже имеющийся хвост - намного проще, чем придумывать его заново :-)